王朝阳部谋反，或称保宁兵变，事情的性质很简单：闹饷。
王朝阳部的番号是总镇外标营，直隶于总兵甘良臣。但是王朝阳不是甘良臣的嫡系，而是前总兵侯良柱的嫡系。
自崇祯年来，由于朝廷税收困难，加之四川的大量税收被解往京城，致使四川官军的日子一年不如一年。
前年，即崇祯十三年，杨嗣昌调大军入川追缴张献忠，按照大明军饷解运的原则，主客两军的军饷均由四川官府支付或者垫支。但因为四川官府确实拿不出多少银子和粮食来，只好从湖广外运。杨嗣昌以督师之尊，被迫在广安城停驻三月以待饷，结果延误了追缴张献忠的最佳时机。一名解饷官因为迟到三日，被气急败坏的杨嗣昌以天子剑斩之，以儆效尤。
去年春夏，实力被大幅削弱的川军在巴州前线失利，巴州、南江一州一县俱失，部队一直溃逃到百丈关。去年初尾随追击张献忠重占通江的知县李存性和副将涂龙，从此信讯全无，廖大亨和四川官府均认为其必死无疑，因此报了个战没。
部队遭到惨重损失，士卒要招募，马匹、兵器、铠甲、服装诸项军资均要补充，这就要花大量的银子。可是四川官府哪里凑得出这样多的银子？他们能将士卒的欠饷补发数月便是好的。
可是前线的领兵大将们却不敢这样。重夺巴州的任务是皇帝下的严旨，没有兵马军械的军队开上去便是送死。于是，当军饷逐渐运到部队之后，大将们想得第一件事不是发饷，而是加快招募补充。朱平槿借给廖大亨的钱粮，渐渐被用在了填补川军多年留下的窟窿上。即便这样，两三只军队依然没有得到补充，或者是补充很少。
最惨的是驻扎百丈关的侯天锡部。
侯天锡为了让侯家东山再起，利用自己的老子侯良柱在永宁卫的势力和威望，在当地拉出来七八百军队，军官和士兵几乎全部是侯氏的族人、家丁和军户。但既然是侯氏私军，当然不可能得到现任总兵甘良臣的大力支持，除了补发三个月的欠饷，他们几乎分文未得。好在侯家在永宁树大根深，又有百顷军田屯垦，这才勉力支撑起了士卒马匹的开销。
其次惨的便是驻扎松潘的副将朱化龙部。
朱化龙本是湘西辰溪人，投军后从小兵当起，参与平定奢安之乱。在经历一段时间的海边生活后，调至四川任松潘副将，期间曾有长沙岛大胜海寇的战功。
在四川西北边境，大明设有两卫三所，以道员一名统领军政，以副将一名、左右参将两名领松潘卫、茂州卫、威州守御千户所、叠溪守御军民千户所（注一）和小河守御千户所及土司诸军。朱化龙驻节松潘城（今松潘县城）、左参将驻节茂州卫、右参将节驻小河所（注二）。
松潘的最高长官，本来应是文职官员松潘道黄谏卿。但倒霉的黄谏卿在赴任途中，刚走到了泸州，就被流贼张献忠破城杀死，于是朱化龙便成了大明在松潘地区主要的军事将领。朱化龙部需留驻当地，震慑生熟诸番，没有进攻巴州的任务；其士卒，大多是当地军卫的军户，有军田屯垦，所以在四川官军严重缺饷的大背景下，朱化龙部成为了被遗忘的角落，粮饷补充极为有限。
最后便是这保宁兵变的主角王朝阳部。
王朝阳部在百顷坝兵败后，将有怨心，士有怒气，军心不稳。在这次巴州攻势中，总兵甘良臣本不想用他们。但因川抚廖大亨有令，这才将他们调往保宁，为大军镇守后路。关于王朝阳部将士们最关心的欠饷补发，甘良臣已经没有余粮了，只好呈文坐镇中路张奏凯军的兵备副使马乾，请他就近予以补充。而马乾坐镇渔溪前线，哪里顾得上身后的王朝阳，于是他又行文保宁知府张继孟，请他代为发放。
官通过控制军队的粮饷，来控制军队，这是大明崇祯年的惯常做法。由驻军亲民官为驻军补给，也是朝廷的规矩。然而兵备副使马乾没有想到，他的一纸行文，为保宁兵变伏下了祸根：
知府张继孟胆大包天，竟然将王朝阳部的军粮和饷钱全数扣发！
……
“时逢秋粮征收的大限，张继孟这贼为了保住自己头上的乌纱帽，他竟然……”
“不对，万大哥！张继孟不是为了秋粮。你们上了他的当！”
贺永年听完万吉富讲完保宁兵变的原因，喝下去的几碗酒已经散发得一干二净。他起身扯开大门，让冬日的冷风呼呼吹了进来。“他不是为了秋粮，他是想逼反你们，然后嫁祸于世子和廖抚！”
“上当？他如今的小命都在弟兄们的刀口下！他有什么好处？”
“好处？”贺永年冷笑道：“杀父杀兄之仇，那是不共戴天！听少爷传回来的消息，自从他爹死了，张继孟像条疯狗一样，时时都在向朝中奸臣写信，告世子和廖抚的黑状，污蔑他们谋反！若不是世子有兵有银，深受蜀地百官万民拥戴，朝中奸臣不敢将世子真的逼反，张继孟这贼子已经得逞了！
万大哥，你再仔细想想，若是这贼子留下遗表，找个心腹送往京师，说世子和廖抚撺掇王朝阳谋反，然后自己悬梁自尽，玩一出死谏的把戏，那样不仅将你们一营兄弟的活路断了，还会引起皇帝对世子和廖抚的疑心。到时朝廷派出钦差彻查……”
“钦差来了，我们便与张继孟对质！”万吉富重重搁下酒碗站了起来，“一人做事一人当！绝不会牵连世子和