这些魔教之人可不是良善之辈，一下子炸开了锅，以各种方式表示反对和抗议，甚至有人暗地里刺杀李仙和王九玄等高级将领。
这一下，终于惹怒了军政府，王九玄又是一道命令发布，让李仙带兵进来治理教徒之事，李仙便又带重兵过来，按照事先拟好的名单，将各大教派的首领几乎都一网打尽，还都关押了起来。
这一下，数十个教派都一下子没了头脑，人心惶惶起来，还好杨天明为人精干，强打着精神召集残留教徒，维持住局面，又跟军政府几番周旋，勉强得到不会对一般低级信徒抓捕的承诺。
趁此机会，杨天明也对信徒做了一番整治，统一信仰，建立组织，把这些徒众都管理起来。
当然，那些被抓住的教派首领的财产也被杨天明吞没，又分出一半送给混元宗和三元观，自己拿另一半用于购买军火建立军队等。