忍者用的忍器分为登器、水器、开器、火器四大类。
登器是忍者攀爬时的器械，包括：结梯、云梯、高梯、叠梯、打钩、长蓑、飞行、忍杖、龙登、蜘梯、探铁、苦无、钩梯、卷梯、云梯十五种。
水器包括：浮桥、沈桥、蒲筏、葛笼筏、水蜘、水搔、鹈、军船等。
开器是开启箱柜和溜门撬锁时用的作案工具，包括：问外、刀曲、延鑰、入子鑰、镊、锥、镰、锁子拔、板撬、锯、钉拔、听铁等。
火器部分由火器及其使用方法组成，其中包括：水火绳配方、水铁炮配方、火箱、不灭明松、打明松法、笼火法、水中火二法、风水火炬五法、火口法、熊火法、熟眠法、杨枝火配方、万年火的使用、义经明松、入子火、生灭明松、烧药法、车火炬法、明眼散方、轻足散方、寒阵火法、水篝法、卷火法、狼炯配方、忽忘散方、暗药方等。
最常见的忍器要算“手里剑”、“忍者刀”、“手甲”和“烟幕弹”了，这几样都是忍者的基本装备，平时出去“作案”，这些东西可一个都不能少。
手里剑包括三种，除了飞镖状手里剑，还有箸手里剑和镰手里剑。箸手里剑象筷子，镰手里剑则像没把的镰刀，而普通手里剑按形状的不同又有棒状、平板型等之分。
现代人从各种忍术秘本中，所得知的忍术武器，主要有七种：手里剑（akibiana）、吹矢（idue）、手甲钩（tekkoukagi）、水蜘蛛（o）。“手里剑”是飞镖，刀尖涂有剧毒。“撒菱”，是逃走时撒在身后的一种菱形武器；凡是凹凸不平，能够刺伤双足的东西，例如天然石头、干燥果实、铁器等，都可以拿来代用。“忍刀”，又叫“忍び刀(にんびとう)”，刀长多为60厘米以下的短刀，刀身又宽又重，以直刀系为主（不同于武士用刀），附有一条长约三公尺的绳子，翻越城墙时，可以当踏脚工具，再利用绳子收回；刀鞘，临危时可以当潜在水中的通气管。“吹矢”，则是毒针，通常藏在笛子内；有时候旅途中必需扮装成艺人，因此，忍者除了必须学吹矢手法，还得练习吹笛技术。“忍杖”，顾名思义，是一根藏有链子、长矛、刀剑等武器的手杖。“手甲钩”，各式各样，有装在指甲上的，有套在手背上的，就看当事者擅长哪种功夫，自己变把戏。“水蜘蛛”，渡河时用的道具，平时可以叠起来藏在包裹内。
忍者的训练
想成为一个真正的忍者就要从小进行近乎于ròu_tǐ摧残似的特殊训练。长期以来，忍术仅为忍者家族世代秘传，外界则很难知其详貌。忍术的训练要求必须从小开始，凡忍者家族成员，不论男女老幼，均须无条件的继承这一家庭职业传统（忍术训练），就忍术训练内容来看，其基本训练主要包括平衡、灵敏、力量、持久以及特殊技巧五个方面。
1.平衡训练：首先从走竹竿开始，至能立于滚圆竹竿上而不滑倒；将竹竿升离地面三尺左右，继续走竹竿，练到行动自如；继续增高竹竿高度，直至三四十尺高度为止，至此身不畏高，翻腾跳扎，如履平地。具备这样的平衡能力后，才能在屋顶、墙头及树木上行走如飞。
2.灵敏训练：训练从幼年开始，多进行灵敏素质专项训练，如跳过插满刀片的绳子，训练后期做危险障碍跑，跑步途中布满许多危险的障碍物，身法稍有不灵或反映略有不敏，即被障碍物致伤。因此，忍术的灵敏要求十分严格。
3.持久力训练：忍术的持久力训练分静、动两种练法。静练法：双手挂于树上，支持全身，地上则放满暗器，要求练者决不能松手跳下来；动练法，采用基本的长跑功夫，要有跑五六千里的耐力。一个优秀的忍术高手，加上跳跃，可以每日跑一百五十多里（每天一个标准马拉松）。
4.力量训练：忍术的力量训练力求最大限度的发挥人体的力量，采用的训练方法很多。除了常规训练外，忍术还包括多种“怪力训练”，忍者通过它进一步磨练意志，忍耐力，生存能力等等。这种怪力训练诸如连续数天不食不动，杀死自己的同伴，以及与猛兽搏斗等，是令人难以想象的地狱式修炼。
5.特殊技巧训练：忍术武技中的特殊技巧训练有多种：诸如潜水屏气、徒手搏斗、剑道、暗器、化装术、药物术、施毒解毒术、听力嗅觉训练……且要有高水平的忍饥耐渴的野外生存能力。
除了飞行隐身外，发放暗器亦是忍术绝技之一。忍术暗器多为毒镖及铜币（边缘开刃），也有键，钩、凿等。忍术暗器应用较多，掷发淬毒铜币是每个忍术高手都应具备的本领。另外、与“飞行术”“发暗器”并称“忍术三绝”的还有“施毒解毒术”。忍术高手个个都精于此道。
通过以上的训练，忍者能获得几十倍于常人的毅力，忍耐力，战斗力，通过忍术训练，在精神高度集中时，人可以处于一种自内向外的激发状态，这时会激发出人的某些超能力。
忍者食用的食物都是以谷类中低卡路里不易肥胖的食品为主，忍者经常用拇指和食指悬空拎起装满重物的米袋，保持自己的体重对忍者来说是很重要的。如忍者不能将体重保