建文帝以为准备停当了，便秘密下令擒拿朱棣，但是没有成功，再加上削藩措施严重威胁藩王利益，坐镇北平的朱棣于1399年（建文元年），起兵反抗，随后挥师南下，史称“靖难之役”。
战争持续四年，此时建文帝已无大将可用，只好起用幸存的老将耿炳文统兵北伐，又派李景隆继续讨伐，而建文帝也缺乏谋略，致使主力不断被歼。
朱棣以北平为基地，适时出击，灵活运用策略，经几次大战消灭官军主力，最后乘胜进军，于1402年（建文四年）攻下帝都应天，战乱中建文帝下落不明，或说于宫中**死，或说由地道逃去，隐藏于云、贵一带为僧。
同年，朱棣即位，就是明成祖，第二年，改元永乐，改北平为京城。1421年，迁都京城，称京城为京师，应天为留都。
看到这里，我就感觉有些违和感，于是我又打开了记载着刘伯温的那个网页，然后略作比较，就知道有些地方确实是不对劲了……