在有备而来的日军重兵进攻之下，哈尔滨仅仅守了两天，便被日军突破阵地，李杜不得已下令撤离哈尔滨。
李杜率部退守依兰，冯占海率部撤往方正一带，邢占清、赵毅率部撤往哈东，驻夹信、元宝镇一带。
李杜、邢占清、冯占海、赵毅等人基本保全了部队，最惨的是丁超，他的司令部设在道里，在张景惠授意下，于镜涛率领反水的警察总队端了丁超的司令部，丁超匆忙间只带了卫队逃出，他的18旅大部被警察总队缴械。最后，丁超只收拢到一千来人。
占领了哈尔滨后，日军对态度一直暧昧不清的马占山失去了信心，开始掉头对付马占山。
齐齐哈尔马占山再次撤走，在海伦地区坚持抗日。自此，日军控制了东北的所有大中城市，完成了对东北的占领。
3月1，在土肥原的策划下，末代皇帝爱新觉罗？溥仪，从天津秘密乘坐日军军舰抵达达东北，成立了伪满洲国，并将长春定为“国都”，改名“新京”,从此长春成为东北的政治、军事、经济、文化,社会中心。
至1944年长春市区面积拓展到80平方公里，人口达121.7万人，超过东京都市区人口，号称亚洲第一大都市。
此后，日军把主要精力放到清剿各地风起云涌的抗日义勇军上，力图首先稳定占领区的统治。
此时，东北三省义勇军已经发展到26路，近三十万人。
辽宁的义勇军主要由黄显声的警察部队、以及**和民间组建的，战斗力相对较弱。而吉林、黑龙江的义勇军主要由原东北军组成，战斗力较强，吉黑两省的义勇军自然就成了日军首先打击的目标。
李杜的自卫军坚持到1933年1月，在日军沿穆棱河向虎林、密山清剿李杜部时，由绥芬河出发的日军右翼，占领八面城、东宁各地后，在小绥芬河将李杜部下刘万奎部包围，刘部缴械投降。被日军重重包围的李杜，不得已，率三千多人退入苏境。同年5月，他本人丢下部队，假道欧洲回国。
冯占海曾组织队伍反攻哈尔滨，一度歼灭日伪军数千人。这让武藤十分恼火，决心首先消灭冯占海。
在日军的大举进攻之下，冯占海只好撤离方正，转入下江。
同年4月，吉林自卫军组织反攻，率军进入哈尔滨香坊一带，日军从水路成功偷袭依兰的李杜，使自卫军顾此失彼，面临两面作战的窘境。
冯占海当即率军南下游击，队伍壮大很快，最多时竟达万余人，改称吉林救**，冯占海自任总司令，还曾向伪吉林省城吉林市发起了反攻。因孤军作战，反援不济，攻城不果转入热河。
在吉黑自卫军反攻哈尔滨时，邢占清担任中路军副总指挥，攻打珠河一战，歼敌日军200余人，伪军1000余人，生擒伪军500余人。但中路军也伤亡2000余人。后因粮弹两亏，中路军撤到吉东。
1933年7月，率部进入苏境，后辗转进入新疆，驻扎伊犁等地。
赵毅赵毅部进入哈东后，自卫军各部一时士气低落，六六三团团长陈德才乘机挑唆部下排挤赵毅，赵毅一气之下弃职进关，在张学良手下任高级参议。热河抗战中，曾奉命进入热河组织义勇军各部抗战，热河沦陷后调任东北军一一二师副师长兼参谋长。
日军从水路突袭依兰，自卫军大本营失守，李杜撤往梨树镇，重整兵马坚持抗敌时。丁超此时却同李杜分道扬镳，径自率卫队撤往宝清，暗中派人同日伪劝降代表接洽。1932年末，日伪军大举进犯下江和哈绥路沿线，自卫军不支，相继溃散，李杜率残部渡江入苏境。丁超却在宝清接受了日伪的劝降条件。
丁超降敌后，日伪对他并不信任，给他一个总务厅嘱托的闲差，直到1938年8月，才委任他为伪通化省省长，次年8月又调任伪安东省省长。两任省长届满，又削其实职，调任伪参议府参议，直至伪满洲国垮台。
对于马占山，武藤更是万分重视，派松木师团主力正面进攻，广濑师团封锁两江，并以飞机沿途轰炸。32年七月下旬在刘家店附近遭到日军平贺、平松两旅团的夹击，全军溃败。
马占山只携数十人遁入深山密林，后经龙门镇绕道前往海拉尔，后经北蒙进入内地。被任命为国民政fu军事委员会委员。
到33年，东北各抗日部队，也就是统称的东北义勇军，主力基本被日军消灭或溃散。
需要提及的是先后退入苏联境内的义勇军的命运。
国民政fu与苏联政fu进行了艰辛的谈判，国民政fu希望苏联能将义勇军经西伯利亚转入北蒙。
但苏联政fu坚决反对。理由是，他们不承认北蒙是中华民国的一个省份，而认为它是一个被军阀宋哲武强占的一个独立国家，苏联政fu无权将中**人转送至一个独立国家。
最后，国民政fu不得不忍气吞声地同意了苏联的建议。即东北抗日义勇军经过苏联西伯利亚区域，长途跋涉转折进入中国新疆。
对于这些人在苏联的生活费用，苏联要求国民政fu先行支付，开口就是三百七十万美元，即平均一人收取100美元。但苏联人拿了钱却不办事，只供给义勇军及家属数量十分有限的食物。
前后进入苏联境内的义勇军有四万来人，其中家属婴幼儿一万多人，到达新疆后，仅剩