对于桦山资纪的所作所为，因为他麾下的日本海军已然全军覆灭，日本国内没有得到任何相关的报告，但日本政府还是从外国报纸的相关报导了解了一定的情况，大久保利通和大隈重信等人得知之后全都大惊失色，尤其当他们得知桦山资纪的炮击竟然造成了包括厦门日本领事馆在内的外国使馆区的重大损失时，更是震惊不已。
那一次，大久保利通当着一干政府要员的面，便大声的骂出了“桦山小贼”的话来！
因为他知道，桦山资纪的蠢行，将要给日本带来极大的麻烦！
事实上，日本政府已经为此付出了不小的代价。在使馆区遭到日舰炮轰后，得知了消息的英法等西方各国政府纷纷向日本政府提出了强烈抗议，要求惩罚相关人员，赔偿损失。在西方列强的联合逼迫下，日本政府被迫赔偿各国损失，以及支付修复使馆的费用，总计付出了60万日元。
对于财政困窘的日本政府来说，60万日元，绝对不是一个小数字。
而到现在为止，日本政府已经为台湾战事花费了近1000万日元的军费！
“我国政府负有对军队管辖不力、致命军队当中的贼徒暴走的责任，但并没有发动战争的责任，这是两件事，不可以混为一谈。”伊藤博文说道，“而且我国政府并没有打算推卸自己应付的责任，而是愿意赔偿贵**民的损失，抚慰这次不幸事件所造成的创伤。”
听到大久保利通和伊藤博文等人在谈判当中绝对不说“战争”、“军队”，而是代之以“不幸事件”、“贼徒”等词，林义哲不由得不佩服日本人的狡猾和外交辞令的纯熟运用。
“既然贵国政府诚心和好，关于战争责任的问题，可暂时搁置。我们先来谈谈关于赔偿的问题。”听到日本人提出愿意赔偿，林义哲明白日本人是想急于达成和议。知道敲日本人竹杠的时机已然到来。
“对于贼徒们给贵国造成的损失，日本政府愿意尽全力进行赔偿。”大久保利通紧盯着林义哲，眼中闪过异样的光亮，“希望日本政府的赔偿，能够抚平这次不幸事件对两国友谊所造成的伤害。”
“那要看贵国政府如何全力赔偿了。”郭嵩焘和崇厚夏家镐交换了一下眼色，微笑着说道。
郭嵩焘的话虽然说得很是和气，但大久保利通和伊藤博文及木户孝允却全都感到心中一寒。
“我方愿意赔偿贵国银元五十万元作为补偿。”大久保利通一边说着，一边紧盯着林义哲的眼睛，观察着他的反应。
听到大久保利通开出的价码，林义哲在心中发出一声大笑。但表面上却丝毫不露声色。
“呵呵，五十万银元，听着可是不少啊！”郭嵩焘面露嘲讽之色，说道，“敢问贵使，这个数字是如何得出来的？”
“这个数字，是我们详细调查这次不幸事件给贵国造成的各种损失，经过仔细计算后得出的。”柳原前光说道。
“你们算得是够仔细的哈。”林义哲冷笑了一声，眼中瞬间放射出凌厉的光芒。令一直紧盯着他的大久保利通吓了一跳。
“五十万银元？贵国的货币真是好值钱啊！”林义哲冷冷的说道，“先不说贵国的那些贼徒们在台湾烧杀抢掠所造成的损失，仅就日本海军在凤山岛附近海面击沉之我国水师兵轮二艘之价值，兑换成贵国货币。就不止五十万银元！贵国政府是把我大清当成了要饭的叫化子了么？”
“这……是我们考虑不周！还请贵大臣见谅！”大久保利通听到林义哲语意不善，立刻率日本使团成员起身，向林义哲齐齐鞠了一躬。
这一次，林义哲没有向往常那样的起身回礼。而是傲然坐在那里没有动弹。而郭嵩焘、崇厚和夏家镐看到林义哲没动弹，也都没有离座，全都端坐在那里。
“请贵大臣提出来赔偿的数目。以供我方参考。”大久保利通行礼完毕后坐下，看到林义哲并没有说话，而是一直在那里阴着脸，心中不免忐忑，说起话来，竟然变得有些急迫。
伊藤博文听到大久保利通的问话，一颗心也禁不住跟着悬了起来。
此时木户孝允和柳原前光，也是和他一样的心情。
这时中国方面的另外三位谈判代表郭嵩焘、崇厚和夏家镐也都将目光集中到了林义哲的身上。
虽然此前林义哲就日方赔款问题和他们进行过探讨，但对于赔款的数目，并没有最后敲定。
由于受中国传统文化当中“含忍”的立国之道影响，崇厚认为无须对日本逼迫太甚，若是日本愿意赔偿，可象征性的参照林义哲在法国遇刺那一次的“成例”，索要50万至80万两白银即可，毕竟“边衅易开不易弥，若因索款而至两国交兵，俄人虎视西北，我于东南重开战端，两面受敌，恐届时所费，远非赔款所能偿。”主张适当对日本人放宽条件，尽快达成和议。
夏家镐则认为崇厚提出的赔款数额过少，毕竟这一次等于是中国和日本打了一场局部战争，仅兵费一项便耗费巨大，“日人赔款，除种种损失，需当算计我之兵费，及闽台两地海道商民之失在内”，“非银二百万两不可。”
郭嵩焘因为事先已经和林义哲私下里“沟通”过，他自认为自己已经猜到了林义哲想从日本人那里榨多少银子的数目，是以那时没有发表自己的意见，而是听林义哲的意见。
但无论是崇厚提出的50万两至80万两白银的“象征性”赔