生卒年月不详，东汉末年颍川阳翟人。曾任东阿令、羽林监、屯田都尉、陈留太守等职。因他英年早逝，所以关于他的生平事迹，史书记载有限，但他所首倡的"屯田制"，却在中国社会的政治、经济和军事发展史上，占有极其重要的地位。
枣祗的出生时间已无法考证，对其活动最早的记录始于汉灵帝中平年间(184-189年)。汉灵帝中平六年(189年)，东汉王朝内部爆发了其历史上最后一次外戚与宦官集团的斗争。大将军何进被宦官杀死后，他的部下又全歼了宦官集团。并州牧董卓带西凉兵进京，废少帝刘辩，立献帝刘协，并自任相国，独揽朝政。他的做法引起了关东各地在镇压黄巾起义过程中发展起来的豪族地主军事集团的极大不满。袁绍、袁术、曹操等关东豪强地主的代表人物，纷纷逃离京师洛阳，到各地组织力量，准备以武力与董卓相抗衡。当时，曹操在陈留也组织了一支5000人的武装力量，准备讨伐董卓。枣祗就是在这个时候奔到曹操麾下，与曹操"始共举义兵，
当时枣祗在社会上已经有很大名气，在他归附曹操后，袁绍亦贪祗，欲得之，并多次派人礼辟枣祗，都被他断然拒绝。枣祗的忠诚，令曹操非常感动，因而他深得曹操的器重。
由枣祗首倡实施的"屯田制"，是在东汉末年豪强地主势力急剧膨胀的历史条件下，封建国家同豪强地主争夺对无地流民的控制权，限制豪强地主无限度地夺取土地而采取的一种特殊制度。它不仅在当时起了一定的积极作用，而且为后世开创了一种大规模的寓兵于农、兵农合一的先例，为后来历代的封建统治阶级所不同程度地仿效，在中国政治、经济、军事发展史上，都占有重要的地位。
枣祗不幸早死，后来曹操怀念其功绩，追赠他为郡太守，同时下令给他的儿子处中封爵，并祭祀枣祗。曹操说，大兴屯田的结果是"丰足军用，摧灭群逆，克定天下，以隆王室"，这是枣祗的功劳，是"不朽之事"。对枣祗的功绩给以充分的肯定。