秦王听取李斯离间各国君臣之计，对于六国，李斯还提出了“先灭韩，以恐他国”的吞并顺序。于是他得到了秦王的赏识，因而被提拔为长史。李斯劝秦王派人持金玉去各国收买、贿赂，离间六国的君臣，果然也收到了效果，之后愈加的得到信任。
正当秦王下决心统一六国的时候，韩国怕被秦国灭掉，派水工郑国到秦鼓动修建水渠，目的是想削弱秦国的人力和物力，牵制秦的东进。后来，郑国修渠的目的暴露了。这时，东方各国也纷纷派间谍来到秦国做宾客，群臣对外来的客卿议论很大，李斯对秦王说：“各国来秦国的人，大抵是为了他们自己国家的利益来秦国做破坏工作的，请大王下令驱逐一切来客。”然而秦王下了逐客令，李斯也在被逐之列。
无奈李斯又给秦王写了一封信，劝秦王不要逐客，这就是有名的《谏逐客书》。他说：
“议论逐客，这是错误的。从前秦穆公求贤人，从西方的戎请来由余，从东方的楚国请来百里奚，从宋国迎来蹇叔，任用从晋国来的丕豹、公孙支。秦穆公任用了这五个人，兼并了二十国，称霸西戎。秦孝公重用商鞅，实行新法，移风易俗，国家富强，打败楚、魏，扩地千里，秦国强大起来。秦惠王用张仪的计谋，拆散了六国的合纵抗秦，迫使各国服从秦国。秦昭王得到范雎，削弱贵戚力量，加强了王权，蚕食诸侯，秦成帝业。这四代王都是由于任用客卿，对秦国才做出了贡献。，如果这四位君王也下令逐客，只会使国家没有富利之实，秦国也没有强大之名。”
也多亏了李斯能言善辩，秦王最后还是采纳了李斯的建议，立即取消了逐客令，李斯仍然受到重用，被封为廷尉。
很快嬴政统一的天下，李斯作为功臣，自然是得到了奖赏，他被嬴政封为了丞相，李斯成了丞相后，很快竟然得知了自己惹怒了湛乐，这可不得了，之后还收到的了轩辕阁招回令，如今李斯正直被重用，如何会回去，直接无视了那召回令，这更加令湛乐震怒，震怒下的湛乐竟然查起了这李斯的入轩辕阁的来由。
这不查不知道，一查吓一跳，李斯竟然不是考核进入的轩辕阁，而是有一个轩辕阁长老特例招进来的，当然这长老不是当年的三千人祖长老，而是后来轩辕阁的大罗修士。
之后湛乐顺藤摸瓜竟然发现这种现象很普遍，哪些后来的长老，都会有一些后代被招进了轩辕阁，这类人没有好的资质，却占用了大量的资源，甚至一些人用的灵丹灵药，是从普通弟子手上扣下来的，而这李斯本就是在一个后辈长老的推荐下被湛乐看重的。
当即湛乐那个恨啊，更多的事愧疚，圣者将这偌大的轩辕阁交给自己，没想到如今已经变得腐朽了，自己对不起圣者啊，当即湛乐辞去了十大议事长老之职，去了肖华的紫霄宫领罪。
肖华得知后也是大怒，本以为这等事不会出现在自己的教派，但这也怪不得湛乐，就连自己这个人教教主不是都没有发现么。