杨伊一从直升机的窗口望向地面，隐约可以看到下面的黄色的荒原上有一个黑点儿——她知道，那是蚁穴的出口，曾经，阿柱就是从这个出口逃离了蚁穴。她已经知道了蚁穴中发生的一切，并且，比任何人都要清楚每一件事情的细节。
直升机在荒原上降落，杨伊一命令警卫人员和其他的随行人员原地待命，她将独自进入蚁穴。与那些荷枪实弹的警卫不同，杨伊一并没有穿着战斗服，也没有带枪。她只是一袭素裙，打扮着像是要去商业中心逛街散心一般。
在张小柱逃离蚁穴之后四个月，蚁穴曾经被重启过好几次，a国政府也有派人进入蚁穴进行查看，但是，都没有派遣真人前往，前往执行任务的，都是替身机器人。
现在，蚁穴的电力再次被恢复了，入口处，杨伊一登上了列车，启动了列车，列车延着一个极缓的坡度，慢慢下行，进入蚁穴的深处。列车匀速前行，隧道中的一盏盏指示灯在视觉中被拉长并移向后方，微风拂动着她的长发。列车前进时，车轮压过轨道接头处，发出有节奏的卡哒声，这种缓慢的节拍，把杨伊一带入黑暗的深处，黑暗之中回忆开始在她眼前浮现：
回忆中，时间回到了两年前，荒原上的那个小旅馆，那个汽车旅馆，那个雷雨之夜。杨伊一渐渐意识到，自己已经被原虫感染了，但，仍然，就像那些不敢去面对事实与疾病的人一样，她知道没有解药但也仍然需要一种解药来安慰自己，无论那药是有效还是没有效。
这种药是杨伊一背着司马绫，托人在a国黑市上买来的，可以在某种程度上抑制原虫的显性，使感染者在血检过程中，不表现出显性特征，从而躲过检查，这样，这些躲过了检查的人就不会被送往隔离区。在a国这样科技和市场高度发达的社会，就有着这样的好处，或者说弊端。
所以，在小旅馆等待之后，两人都拿到了血检结果，而血检结果都是“未感染”。
杨伊一回忆起了在小旅馆最后的那一夜，那个雷雨之夜。她浑身躁热难忍，于是，她去淋浴。她没有想到自己会在浴室中昏倒，然后被巨蝠劫走，而后，她更是得知了巨蝠居然被阿柱派来的。
……列车还在缓缓的前行，回忆也还在缓缓的浮现……
微风拂动着她的起来，杨伊一有些怀念活在幻境中，或者说梦境中的那些日子，因为梦无论如何可怕，都不及现实的万分之一。而且，那些梦境都阿柱精心为自己准备的，她开始并不知道自己被巨蝠劫走，也不知科巨蝠是被阿柱派来的，她甚至不知道巨蝠的存在，要知道，那时，未知生物还没有在a国的大地上出现过。
杨伊一只是以为自己回到了c国，回到了自己的别墅中。身处梦境的她不知道自己是怎么一下子就从a国回到了c国，那时，在梦境中的感觉使她觉得a国经历才是一场梦。而司马绫，圣跌戈，天使城，满城的机器人，天使城的领市馆……这一切才更像是梦。
然而，正如其他所有沉浸在梦境中无法自拔并且以为现实经历是梦境的人一样，如果实在无法区分梦境与现实，那么只需记住一点：梦，无论多美，总是要醒的。
……列车在黑暗中前行，这正如变异人的生活，有光线从天顶射入，却没有光明透进心底，所以心底里，仍是黑暗……在杨伊一的回忆中，无论是张小柱那个秘密的会所，还是变异人进行交易的那些酒吧……一切浸没于黑暗之中……
如果忘记文明的面具，社会对于变异人说只是一座黑暗的森林，而不幸的是，他们正好不是这森林里的猎人，而是猎物。变异人甚至不用立志做一个对社会有用的人，也不用为了成为一个对社会有用的人而努力，因为他们生来就是“有用的人”，他们的身体里充满了“有用的基因”。
两年前的那一天，在幻境中，杨伊一记得阿柱说要带自己去看一个实验室。那个实验室的名字叫蚁穴，其实，与现在的现实一样，在那一天的幻境中，杨伊一就已经踏上了这列列车。
当杨伊一的回忆来到这里时，现实与回忆已经完全重叠在了一起，她知道自己是第一次来这里，但是她感觉自己早已经来过无数次了。
幻境之中，张小柱带她来到了蚁穴，看到了实验室的实台上躺着一个孩子，他和她孩子——张去影。能知道，能想像与亲眼在幻境中目睹是不一样的。孩子在挣扎，冰冷的手铐将他铐在实验台上。隔着玻璃，杨伊一看到了孩子的叫喊和挣扎，但她听不见孩子的声音。她向实验室里的那些人哀求，求他们放过自己的孩子，而同样的，他们也听不见自己的叫喊。
此时幻境中，的张小柱就站在她的身边，他扶着她，但他也救不了孩子……然后是血腥的一幕……
孩子的血，溅到了玻璃上，也溅到了杨伊一的眼里，滴到了她的心里。
“我想，你现在应该明白我的意思了。”张小柱对她说道，“我们必须拥有自己的国家。”
……列车在黑暗中前行，入口处的光芒越来越弱，缩成了一个光点，光点在不断变小，黑暗中唯一的光明也在慢慢被吞噬。但，杨伊一一直知道阿柱在黑暗中前行的执着，是因为他心里有一个巨大的光明——变异人的国度，变异人自己的国度，不是一个小小的公司，而是一个大大的国度，甚至是一颗星球……
杨伊一的眼角闪过一丝泪光