寺社势力的膨胀，很快就惹来了世俗界强人的忌惮，战国时代崛起的强人织田信长，开始谋求限制这些寺社的势力、剥夺他们的武装力量，很快就和一向宗产生了武力冲突。
在石山合战当中，本愿寺和盟友朝仓氏一起和织田信长决战，但是最后败于织田信长，一向宗也由此受到了绝大打击，各地的暴乱也随之戛然而止。
在织田信长的野心下，其他寺社也遭遇了同样的打击，其中历史悠久、占有莫大财富而且在佛门地位极高的延历寺，也因为屡屡不听从他的命令，而成为了他打击的重点目标。
他下令纵兵前往延历寺的本山比叡山，声言要把这座宗教圣山夷为平地。
在他的命令下，他的部下封锁一切下山通路，然后纵起大火，对延历寺开始了残酷的围歼战。传言本愿寺的根本中堂以下山王二十一社全被焚毁，包括僧侣、信徒在内约三四千人，不分男女老幼，均惨遭屠杀。
火烧比叡山因此信长这一行为为众多寺社怨恨，并且送予他“第六天魔王”的称号。大家都传说织田信长是因为信仰了南蛮传过来的洋教，所以才做下了这些疯狂之举——虽然其实信长并不是因为宗教信仰的缘故而做出这些行为的。
在织田信长死后，丰臣秀吉以及后来的德川家康相继统治日本，他们对寺社势力的做法不再那么激进，但是暗地里还是以限制为主。
在持续三代人的打击之下，原本庞大的寺社势力开始烟消云散，寺社的土地和财富大部分落入到了幕府和各地的藩主之手。本愿寺则在德川家康的支持之下，出现了大分裂，再也无法对幕府的统治构成威胁。
由此也可以预想得到，原本的寺社势力应该也是对幕府十分不满。如果大汉打出一个消灭洋教，协助日本恢复信仰的纯洁，并且保证愿意让寺社恢复原本的财富和地位的话，这些寺社应该会心向大汉。
当听完了周璞的解释之后，赵松和严广陷入到了深思当中，显然开始意动了。
“这些寺社不是已经被打击得很惨了吗？他又有什么力量来支持我们呢？”片刻之后，赵松提出了质疑。
“百足之虫死而不僵，虽然寺社如今大不如前，但是毕竟千百年来信仰流传，他们拥有很大的话语权，在下层当中尤其受尊重。”周璞马上回答，“我们从外面入侵日本，最忌讳的就是让日本人心齐整，所以拉拢寺社，让幕府人心不稳，方为上策。我们镇压天主教民，然后宣称要帮寺社恢复地位，肯定会深得寺社欢喜。”
顿了一顿之后，他继续说了下去，“另外……对我们战后的安排来说，日本的力量越分散，就越容易为我们所掌控……”
赵松和严广对视了一眼，他们终于觉得周璞所言十分有道理。
“此议可行。”赵松低声说，“现在反正我们大军要修整，等长崎港差不多修好之后才能继续大规模行动，所以调出一些兵协助各地藩主镇压天主教民，也抽得出来空。”
“演戏就要做全套，既然两位决定要协助镇压，那我也不能闲着。”眼见他们答应了自己的提议，周璞也喜形于色，“我这阵子也接见一下九州岛各地的僧寺，让他们知道我们大汉的诚意吧。魔王和幕府是他们的敌人，我们就是他们的朋友了。”
在毁灭了这么多敌对的藩主之后，九州现在已经有了不少无主之地，虽然大汉答应了要把整个九州岛送给岛津忠恒，但是送一点土地给各个僧院，想必岛津家也说不出什么话来。