大隈重信担任日本内阁的新一任首相,没有因为刺客是俄国人,就冒然和俄国人开战,他和伊藤博文一样,力压军部中的主战派,派西乡从道到长崎继续和宋骁飞和谈。伊藤博文被刺杀后,英美的舆论大多偏向于同情日本,宋骁飞担心中日如果再开战,英美会同意租铁甲军舰给日本人,加上刺杀伊藤博文推迟日本宪政的目的已经达到,于是在赔款方面作了让步,最后中日达成了和议,将“长崎事件”定性为一起因语言不通导致的误会:每一名逝去的北洋水兵赔款五千两白银,受伤的北洋水兵获赔一百两白银,立即付清。
但对于琉球复国和东亚海权,宋骁飞毫不让步,西乡从道最后忍气吞声,做出了让步,同意释放国王尚特琉球,而且承认中国对对马海峡、台湾海峡、东海、南海的制海权,宋骁飞的斗争,取得了艰难的胜利,为他下一步巩固中国的海防打下了坚实的基础。